Inici / Formulari 2 - laboratori (quantificació)

[!] Important: no has iniciat sessió; les dades que posis al formulari no es guardaran. Vés a l'inici per iniciar sessió.


Carregar un formulari
Inicia sessió per veure els formularis guardats
[validat per admin] [no validat per admin] [complet] [incomplet] formulari [id:{{f.id}}] [OBS] — creat: [{{f.creat}} UTC] per [{{f.creat_per}}] [checksum:{{calcula_checksum(f.json)}}]
  • vista prèvia del formulari
    
                        
  • Observacions mostres:
    • {{mostra.id_mostra}} - {{mostra.observacions}}

consell: elimina formularis parcialment omplerts i queda't amb un sol formulari per data (el més actualitzat).


Formulari [id:{{formulari_carregat.id}}] — creat: [{{formulari_carregat.creat}} UTC] per [{{formulari_carregat.creat_per}}] Nou formulari

Laboratori
Investigador/a a càrrec
Protocol concentració/extracció
Mètode concentració
Data concentració
Control intern procés Concentració Extracció
Concentració de l'estoc Concentració Extracció
Volum afegit Concentració Extracció
Protocol RT-qPCR
Kit extracció RNA
Instrument qPCR
Kit RT qPCR
Observacions generals
Dianes
Nom diana Primers/Sonda LD experimental (95%)
(CG/rx)
LQ experimental
(CV 35%)
(CG/rx)
Eficiència RT-qPCR (%) Recta patró (y = a·x + b) Opcions
Pendent (a) Ordenada (b) r2 Threshold

Resultats quantificació ({{formulari.mostres.length}} mostres)

Mostra {{i+1}} : {{mostra.id_mostra}} (Control procés) (mostra invalidada per admin)
ID mostra ID mostra format: "DXXX-AAAA-MM-DD", per exemple: "DABR-2020-07-30" format: CP-AAAA-MM-DD, per exemple: "CP-2020-07-30"
Data anàlisi molecular
Volum mostra processat {{mostra.volum_processat.unitat}}
Volum control intern {{mostra.volum_control_intern.unitat}}
Volum concentrat {{mostra.volum_concentrat.unitat}}
Factor concentració (x)
Volum de concentrat per extracció
Volum extracte RNA {{mostra.volum_extracte_RNA.unitat}}
Volum RNA per RT-qPCR {{mostra.volum_RNA_RT_qPCR.unitat}}
Volum equivalent analitzat mL
Valor puntual [{{mostra.get_camps_diferents_de_100()}} valor/s de Ct diferent/s de 100]
Observacions mostra
Dianes
Nom diana Mostra directa Mostra 1/10 Concentració final (CG/L) Categoria (log) Categoria Abs (log) Recuperació (%)
LDt: {{ mostra.get_LD(quant).LDt.toExponential(2) }} | LDe: {{ mostra.get_LD(quant).LDe.toExponential(2) }} | LQ: {{ mostra.get_LD(quant).LQ.toExponential(2) }}
{{quant.diana.nom}}
(control intern)
Ct ({{ dil=='Ct_1'?'1':'1/10' }}) Concentració (CG/L)
rep#{{i+1}} {{ mostra.get_concentracio(quant, dil, i).toExponential(4) }}
Concentració mitjana → {{ calcula_mitjana([ mostra.get_concentracio(quant, dil, 0), mostra.get_concentracio(quant, dil, 1), ]).toExponential(4) }}
{{ mostra.get_concentracio_final(quant).toExponential(4) }} {{ ( Math.log10( mostra.get_concentracio_final(quant) ) - Math.log10( mostra.get_LD(quant).LDt ) ).toFixed(4) }} {{ ( Math.log10( mostra.get_concentracio_final(quant) ) ).toFixed(4) }}
Recuperació (%)
Concentració {{get_recuperacio(mostra,quant).rec_conc.toFixed(4)}}
Extracció {{get_recuperacio(mostra,quant).rec_extr.toFixed(4)}}
Variants ({{mostra.variants.length}}) Nota: cal reportar sempre "Wuhan" i la mutació d'interès (i.e. "R346K")
Ct (1) Ct (1/10)
rep#1 rep#1
rep#2 rep#2

PLATAFORMA VISUALITZACIÓ (sarsaigua.icra.cat)
Estan les dades llestes per visualitzar?

Nota: el formulari carregat ja ha estat validat per admin, i no es pot modificar.
Si vols modificar-lo posa't en contacte amb coordinaciosars@icra.cat indicant el nº de formulari (id:{{formulari_carregat.id}})