formulari 2 - laboratori

[!] Important: no has iniciat sessió; les dades que posis al formulari no es guardaran. Vés a l'inici per iniciar sessió.

Carregar un formulari

Inicia sessió per veure els formularis guardats

[validat per admin] [no validat per admin] [complet] [incomplet] formulari [id:{{f.id}}] [OBS] — creat: [{{f.creat}} UTC] per [{{f.creat_per}}] [checksum:{{calcula_checksum(f.json)}}]

—
vista prèvia del formulari
Observacions mostres:
- {{mostra.id_mostra}} - {{mostra.observacions}}

consell: elimina formularis parcialment omplerts i queda't amb un sol formulari per data (el més actualitzat).

Formulari [id:{{formulari_carregat.id}}] — creat: [{{formulari_carregat.creat}} UTC] per [{{formulari_carregat.creat_per}}] Nou formulari

Protocol concentració/extracció
Laboratori
Investigador/a a càrrec
Mètode concentració
Data concentració
Control intern procés	Concentració	Extracció
Concentració de l'estoc	Concentració	Extracció
Volum afegit	Concentració	Extracció
Protocol RT-qPCR
Kit extracció RNA
Instrument qPCR
Kit RT qPCR
Observacions generals

Dianes
Nom diana	Primers/Sonda	LD experimental (95%) (CG/rx)	LQ experimental (CV 35%) (CG/rx)	Eficiència RT-qPCR (%)	Recta patró (y = a·x + b)				Opcions
Nom diana	Primers/Sonda	LD experimental (95%) (CG/rx)	LQ experimental (CV 35%) (CG/rx)	Eficiència RT-qPCR (%)	Pendent (a)	Ordenada (b)	r²	Threshold	Opcions

Resultats quantificació ({{formulari.mostres.length}} mostres)

Anar a la mostra: {{i+1}} ({{mostra.id_mostra}}) [OBS] [INV] |

Mostra {{i+1}} : {{mostra.id_mostra}} (Control procés) (mostra invalidada per admin)

↑ top

ID mostra

format: "DXXX-AAAA-MM-DD", per exemple: "DABR-2020-07-30" format: CP-AAAA-MM-DD, per exemple: "CP-2020-07-30"

Data anàlisi molecular

Volum mostra processat

Volum control intern

Volum concentrat

Factor concentració (x)

Volum de concentrat per extracció

Volum extracte RNA

Volum RNA per RT-qPCR

Volum equivalent analitzat

Valor puntual

({{mostra.valor_puntual?'Sí':'No'}}) — [{{mostra.get_camps_diferents_de_100()}} valor/s de Ct diferent/s de 100]

Observacions mostra

Dianes

Nom diana

Mostra directa

Mostra 1/10

Concentració final (CG/L)

Categoria (log)

Categoria Abs (log)

Recuperació (%)

LDt: {{ mostra.get_LD(quant).LDt.toExponential(2) }} | LDe: {{ mostra.get_LD(quant).LDe.toExponential(2) }} | LQ: {{ mostra.get_LD(quant).LQ.toExponential(2) }}

(control intern)

Ct ({{ dil=='Ct_1'?'1':'1/10' }})		Concentració (CG/L)
rep#{{i+1}}		{{ mostra.get_concentracio(quant, dil, i).toExponential(4) }}
Concentració mitjana →		{{ calcula_mitjana([ mostra.get_concentracio(quant, dil, 0), mostra.get_concentracio(quant, dil, 1), ]).toExponential(4) }}

{{ mostra.get_concentracio_final(quant).toExponential(4) }}

{{ ( Math.log10( mostra.get_concentracio_final(quant) ) - Math.log10( mostra.get_LD(quant).LDt ) ).toFixed(4) }}

{{ ( Math.log10( mostra.get_concentracio_final(quant) ) ).toFixed(4) }}

Recuperació (%)
Concentració	{{get_recuperacio(mostra,quant).rec_conc.toFixed(4)}}
Extracció	{{get_recuperacio(mostra,quant).rec_extr.toFixed(4)}}

Variants ({{mostra.variants.length}})

Nota: cal reportar sempre "Wuhan" i la mutació d'interès (i.e. "R346K")

	Ct (1)		Ct (1/10)
	rep#1		rep#1
	rep#2		rep#2

PLATAFORMA VISUALITZACIÓ (sarsaigua.icra.cat)
Estan les dades llestes per visualitzar?	No Sí

Nota: el formulari carregat ja ha estat validat per admin, i no es pot modificar.
Si vols modificar-lo posa't en contacte amb coordinaciosars@icra.cat indicant el nº de formulari (id:{{formulari_carregat.id}})

Inici / Formulari 2 - laboratori (quantificació)

Formulari [id:{{formulari_carregat.id}}] — creat: [{{formulari_carregat.creat}} UTC] per [{{formulari_carregat.creat_per}}] Nou formulari